Dua jenis ikatan hidrogen telah dikenal: ikatan hidrogen antarmolekul dan intramolekul. Antarmolekul berarti dalam molekul yang sama dan Intramolekul adalah gaya dalam dua atom dalam suatu molekul . Karena ikatan hidrogen, terjadi peningkatan gaya agregasi antarmolekul yang tercermin dalam titik didih dan kelarutan senyawa organik.
Ini adalah jenis khusus interaksi dipol-dipol yang terjadi secara khusus antara atom hidrogen yang terikat pada atom oksigen, nitrogen, atau fluor. Ikatan hidrogen antarmolekul menghasilkan asosiasi molekul. Oleh karena itu, biasanya meningkatkan titik lebur, titik didih, viskositas, tegangan permukaan, kelarutan, dll. Setiap unsur yang dilekati hidrogen tidak hanya negatif secara signifikan tetapi juga memiliki setidaknya satu pasangan elektron bebas ‘aktif’.
Pembentukan ikatan hidrogen antarmolekul menurunkan kekuatan asam. Misalnya, HBr lebih lemah dari HI dan H2O lebih lemah dari H2S. Agar suatu zat dapat larut dalam air, zat tersebut harus dapat membuat ikatan hidrogen dengan air. Setiap molekul yang memiliki atom hidrogen yang terikat langsung ke oksigen atau nitrogen mampu mengikat hidrogen. Molekul seperti itu akan selalu memiliki titik didih lebih tinggi daripada molekul berukuran sama yang tidak memiliki gugus -OH atau -NH. Ikatan hidrogen juga terjadi pada molekul organik yang mengandung gugus NH – dengan cara yang sama seperti yang terjadi pada amonia. Contohnya berkisar dari molekul sederhana seperti CH 3 NH 2 (metilamin) hingga molekul besar seperti protein dan DNA.