Nuklease adalah enzim yang memiliki kemampuan untuk membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat. Ini termasuk dalam kelompok enzim hidrolase karena menghidrolisis ikatan kimia antara nukleotida. Enzim ini sangat penting untuk mekanisme perbaikan DNA alami yang terjadi di dalam sel dan dalam proses bioteknologi seperti kloning gen, teknologi DNA rekombinan, RFLP, AFLP, sekuens gen, terapi gen, pemetaan genom dll, karena mereka mencari situs pembatasan tertentu dan membelah ikatan tersebut dan menghasilkan fragmen restriksi. Lebih dari 100 restriksi endonuklease diidentifikasi pada bakteri dan archaea dan diperoleh untuk tujuan komersial.
Sebelum melihat perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease, penting untuk mengetahui apa sebenarnya nuklease. Nuklease adalah enzim yang mampu membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat. Endonuklease dan eksonuklease adalah dua klasifikasi nukleases. Perbedaan utama antara endonuklease dan eksonuklease adalah endonuklease yang menghasilkan ikatan antara nukleotida di dalam molekul asam nukleat sedangkan eksonuklease membelah ikatan antara nukleotida pada ujung 3 ‘atau 5’ dari molekul asam nukleat.
Apa itu Nuklease?
Nuklease adalah enzim yang memiliki kemampuan untuk membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat. Ini termasuk dalam kelompok enzim hidrolase karena menghidrolisis ikatan kimia antara nukleotida. Enzim ini sangat penting untuk mekanisme perbaikan DNA alami yang terjadi di dalam sel dan dalam proses bioteknologi seperti kloning gen, teknologi DNA rekombinan, RFLP, AFLP, sekuens gen, terapi gen, pemetaan genom dll.
Ada dua jenis utama nukleases: ribonuklease dan deoksibonuklease, yang bertindak dan memutus ikatan kimia antara monomer RNA dan DNA. Menurut situs aksi nukleases, mereka dikategorikan menjadi dua kelompok yaitu endonuklease dan eksonuklease. Endonuklease mengenali daerah urutan spesifik asam nukleat dan membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang berada di tengah asam nukleat. Eksonuslease membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang berada di ujung asam nukleat.
Apa itu Endonuklease
Endonuklease adalah sejenis nuklease yang memotong asam nukleat dari tengahnya. Ini mengenali urutan nukleotida spesifik asam nukleat dan memutus ikatan kimia antara nukleotida. Mereka juga dikenal sebagai endonuklease pembatasan
karena mereka mencari situs pembatasan tertentu dan membelah ikatan tersebut dan menghasilkan fragmen restriksi. Lebih dari 100 restriksi endonuklease diidentifikasi pada bakteri dan archaea dan diperoleh untuk tujuan komersial.
Endonuklease pembatas banyak digunakan dalam bioteknologi. Mereka memainkan peran penting dalam kloning molekuler. Kebanyakan dari mereka adalah enzim dimer yang terdiri dari dua subunit protein. Dua subunit protein membungkus DNA beruntai ganda dan memisahkan kedua untai dari kedua sisi secara terpisah. Ada ratusan jenis restriksi endonuklease dengan situs pengenalan unik pada bakteri. Karena spesifisitasnya yang tinggi dalam batasan, mereka hanya berpaut pada urutan tertentu. Oleh karena itu, mereka dianggap sebagai alat molekuler yang sangat berguna dalam teknologi DNA rekombinan. Tanpa pembatasan endonuklease, produksi molekul DNA rekombinan tidak mungkin dilakukan. Penciptaan molekul DNA rekombinan adalah langkah dasar teknologi biologis molekuler. Untuk memahami pengenalan urutan unik dengan restriksi endonuklease, contoh berikut akan membantu pembaca. Bam HI adalah endonuklease restriksi yang mencari situs restriksi berikut dalam molekul DNA (situs ditunjukkan dengan huruf merah).
Apa itu Eksonuklease?
Eksonuklease adalah enzim nuklease yang memisahkan ikatan kimia antara nukleotida pada ujung rantai asam nukleat 3 atau 5. Ini menghancurkan satu nukleotida tunggal di ujung rantai dan menghasilkan nukleosida dengan memindahkan gugus fosfat ke air. Eksonukleaseditemukan di archaea, bakteri, dan eukariota. Di E coli, ada 17 eksonuklease yang berbeda yang hadir termasuk poliminas DNA 1, 2 dan 3. Beberapa DNA polimerase menunjukkan aktivitas proofreading eksonuklease 3 ‘sampai 5’.
Eksonuklease penting dalam perbaikan DNA, rekombinasi genetik, pencegahan terjadinya mutasi, stabilisasi genom, dll.
Apa perbedaan antara Endonuklease dan Eksonuklease?
- Endonuklease adalah sejenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida dalam molekul asam nukleat.
- Eksonuklease adalah sejenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida pada ujung 3 ‘atau 5’ dari molekul asam nukleat. Endonuklease menghasilkan fragmen restriksi oleonukleotida