Contoh kasus pelanggaran HAM yang pernah terjadi di Indonesia adalah sebagai berikut.
- 1. Kasus Marsinah.
- 2. Kerusuhan Tanjung Priok tanggal 12 September 1984.
- 3. Pelanggaran HAM di daerah konflik yang diberi status Daerah Operasi Militer (DOM) di Aceh.
- 4. Sepanjang tahun 80-an, dalam rangka me- nanggulangi aksi-aksi kriminal yang semakin meningkat, telah terjadi pembunuhan ter- hadap ”para penjahat” secara misterius yang terkenal dengan istilah ”petrus” (penembakan misterius).
- 5. Penembakan mahasiswa Universitas Trisakti pada tanggal 12 Mei 1998.
- 6. Tragedi Semanggi I pada tanggal 13 November 1998.
- 7. Pembunuhan Munir sebagai aktivis HAM Indonesia pada tanggal 7 September 2004.
- 8. Tragedi perang suku di Poso Sulawesi tengah pada tahun 1998 – 2000
- 9. Konflik Suku Dayak dan Madura di Sampit pada tahun 2001
- 10. Tragedi BOM Bali pada tahun 2002 yang dilakukan oleh kelompok teroris asal Indonesia